เมื่อชินจังและเพื่อนๆ ได้พบกับสาวน้อยลึกลับนามว่า โทคิโกะ ที่อ้างตัวเป็นสายลับจากองค์กรลับ เธอชวนพวกเขาไปปฏิบัติภารกิจช่วยโลกจากการคุกคามของกลุ่มวายร้ายที่วางแผนใช้เทคโนโลยีควบคุมจิตใจ ชินจังต้องใช้ความซ่าและไหวพริบสุดป่วนของเขาในการแทรกซึมฐานทัพลับ พร้อมกับครอบครัวโนฮาระที่ดันพลอยเข้าไปพัวพันกับการต่อสู้ครั้งใหญ่ การผจญภัยครั้งนี้จะทำให้ชินจังได้พิสูจน์ว่าเด็กขี้เล่นก็เป็นฮีโร่ได้เหมือนกัน
