ในซีซั่นที่ 3 เอเยนต์ปีเตอร์ ซัทเทอร์แลนด์ต้องเผชิญกับภัยคุกคามระดับโลกครั้งใหม่ เมื่อองค์กรลึกลับที่แทรกซึมอยู่ในทำเนียบขาววางแผนโจมตีโครงสร้างพื้นฐานสำคัญของประเทศ ภารกิจของเขาครั้งนี้พาไปสู่การเปิดโปงสายลับสองหน้าภายในหน่วยข่าวกรอง และต้องร่วมมือกับพันธมิตรที่ไม่คาดคิดเพื่อหยุดยั้งหายนะ การไล่ล่าที่เต็มไปด้วยระทึกขวัญและการหักหลังทำให้ปีเตอร์ต้องตั้งคำถามถึงความไว้วางใจที่มีต่อคนรอบข้าง ขณะเดียวกันความสัมพันธ์กับโรสก็ถูกทดสอบอย่างหนักจากความลับที่ถูกเปิดเผย
