ในโลกที่ถูกครอบงำโดยเครื่องจักร มนุษย์กลุ่มสุดท้ายต่อสู้เพื่อปกป้องไซอัน เมืองใต้ดินแห่งสุดท้ายของมนุษยชาติ จากการรุกรานของเซนทิเนลส์ นีโอต้องค้นหาจุดสมดุลระหว่างพลังที่ไร้ขีดจำกัดของเขากับการเสียสละที่จำเป็น เพื่อยุติสงครามระหว่างมนุษย์และเครื่องจักร ขณะเดียวกันเขาต้องเผชิญหน้ากับสมิธที่กลายเป็นภัยคุกคามที่ร้ายแรงยิ่งกว่าเดิม การต่อสู้ครั้งสุดท้ายนี้จะกำหนดชะตากรรมของทุกสิ่งที่มีอยู่