ปี 2002 มิยาโกะ เด็กสาวผู้มีพลังจิตพิเศษเดินทางข้ามเวลามาจากโลกอนาคตที่ถูกมนุษย์ต่างดาวยึดครอง เธอตามล่าหน่วยสอดแนมของเอเลี่ยนที่แฝงตัวอยู่ในญี่ปุ่นยุคปัจจุบัน และได้พบกับเคนจิ ชายหนุ่มผู้มีปมในอดีตซึ่งกลายเป็นคู่หูคนสำคัญของเธอ ทั้งคู่ต้องร่วมมือกันหยุดยั้งแผนการล้างเผ่าพันธุ์มนุษย์ก่อนที่หายนะจะเริ่มต้นขึ้น แต่ยิ่งสืบหาความจริงก็ยิ่งพบว่าศัตรูที่แท้จริงอาจซ่อนตัวอยู่ใกล้ตัวกว่าที่คิด
