สามปีหลังเหตุการณ์ที่อิสลานูบลาร์ ภูเขาไฟใต้น้ำใกล้ปะทุทำให้ไดโนเสาร์เสี่ยงสูญพันธุ์อีกครั้ง โอเวนและแคลร์ถูกชักชวนให้กลับไปช่วยเหลือเหล่าสัตว์ดึกดำบรรพ์ แต่ภารกิจกู้ภัยกลับกลายเป็นแผนชั่วร้ายของกลุ่มทุนที่ต้องการนำไดโนเสาร์มาประมูลเพื่อใช้เป็นอาวุธสงคราม การต่อสู้เพื่อปกป้องสิ่งมีชีวิตที่เหลืออยู่จึงต้องเผชิญทั้งภูเขาไฟถล่มและมนุษย์ที่โลภมาก
