องค์กรชุดดำได้ส่งมือสังหารปริศนาที่มีรหัสนามว่า "เรเวน" มาลอบสังหารโคกูโร่ โจซากิ ผู้ที่อาจเป็นกุญแจสำคัญในการเปิดโปงความลับของพวกเขา โคนันต้องปกป้องเป้าหมายพร้อมกับไขปริศนาที่เชื่อมโยงกับอดีตของไฮบาระ ขณะที่เงามืดของนักล่าทรชนทมิฬกำลังไล่ล่าทุกฝีก้าว การต่อสู้ครั้งนี้จะนำโคนันไปสู่การเผชิญหน้ากับองค์กรที่เด็ดขาดที่สุดเท่าที่เคยมีมา