วิกฤตครั้งใหม่ถาโถมเมื่อวิลเลียม สไตรเกอร์ อดีตพันเอกผู้เกลียดชังมนุษย์กลายพันธุ์ เปิดฉากโจมตีโรงเรียนของศาสตราจารย์เอ็กซ์เวียร์ ด้วยแผนชั่วร้ายที่อาจทำลายล้างเผ่าพันธุ์ทั้งมวล วูล์ฟเวอรีนต้องเผชิญหน้ากับอดีตอันมืดมนของตัวเอง ขณะที่ไซคลอปส์ จีน เกรย์ และสตอร์มร่วมมือกับแม็กนีโตเพื่อหยุดยั้งศัตรูที่แข็งแกร่งที่สุดเท่าที่เคยเผชิญมา การต่อสู้เพื่อความอยู่รอดทำให้พันธมิตรเดิมกลายเป็นศัตรู และมิตรภาพถูกทดสอบอย่างถึงขีดสุด