ปี 2199 มนุษยชาติถูกครอบงำโดยเครื่องจักรอัจฉริยะที่ใช้ร่างกายมนุษย์เป็นแหล่งพลังงาน โทมัส แอนเดอร์สัน แฮกเกอร์หนุ่มผู้สงสัยในโลกที่เขาอาศัยอยู่ ได้รับการติดต่อจากกลุ่มกบฏลึกลับที่นำโดยมอฟีอุส พวกเขาเปิดเผยความจริงอันน่าสะพรึงกลัวว่าโลกที่เขารู้จักเป็นเพียงภาพลวงตาที่เรียกว่าเดอะ เมทริคซ์ โทมัสต้องเลือกว่าจะกินยาเม็ดสีแดงเพื่อรู้ความจริงหรือยาเม็ดสีน้ำเงินเพื่อกลับไปใช้ชีวิตปกติ การตัดสินใจครั้งนี้จะนำเขาไปสู่การต่อสู้เพื่อปลดปล่อยมนุษยชาติจากพันธนาการของเครื่องจักร
