สี่เต่านินจาผู้รักปาร์ตี้และกลายพันธุ์จากท่อระบายน้ำนิวยอร์ก ใฝ่ฝันอยากเป็นฮีโร่ที่สังคมยอมรับ หลังได้พบกับเอพริล โอนีล นักข่าวสาวผู้ทะเยอทะยาน พวกเขาต้องร่วมมือกันเพื่อปราบปรามแก๊งอาชญากรกลายพันธุ์สุดแสบที่นำโดยซูเปอร์ฟลาย แต่การต่อสู้ครั้งนี้ไม่ใช่แค่การปกป้องเมือง แต่ยังเป็นการพิสูจน์ให้โลกเห็นว่าแม้จะเป็นตัวประหลาดก็สามารถเป็นฮีโร่ได้
