ปีเตอร์ ปาร์คเกอร์ไปเที่ยวภาคพื้นยุโรปกับเพื่อนร่วมชั้น แต่แผนการพักผ่อนกลับพังเมื่อนิค ฟิวรีปรากฏตัวพร้อมภารกิจลับให้สไปเดอร์-แมนร่วมมือกับมิสทีริโอเพื่อต่อสู้กับธาตุอสูรยักษ์ที่คุกคามเมืองต่างๆ ท่ามกลางความสับสนระหว่างความรับผิดชอบกับความฝันวัยรุ่น ปีเตอร์ต้องเรียนรู้ว่าฮีโร่ที่แท้จริงต้องตัดสินใจด้วยตัวเอง แม้จะต้องแลกกับสิ่งที่รักที่สุดก็ตาม
