เชร็คที่เคยอยากให้ชีวิตกลับมาเป็นเหมือนวันเก่าๆ ได้เซ็นสัญญากับรัมเพิลสติลท์สกินเพื่อแลกกับเวลาปกติแค่วันเดียว แต่กลับพบว่าตัวเองตกอยู่ในโลกที่เขาไม่เคยเกิด และฟิโอน่าเป็นหัวหน้ากองกำลังต่อต้านโจรสลัดโอเกร เชร็คต้องหาทางทำให้ฟิโอน่าตกหลุมรักเขาอีกครั้งภายในเวลาอันจำกัด ก่อนที่รัมเพิลสติลท์สกินจะยึดครองอาณาจักรและทำให้เชร็คหายไปตลอดกาล
