เมื่ออาวุธชีวภาพสุดอันตรายตกไปอยู่ในมือขององค์กรคอบร้าทมิฬที่ต้องการทำลายล้างโลก กองกำลังพิเศษจีไอโจจึงต้องรวมตัวกันเพื่อหยุดยั้งแผนชั่วร้ายนี้ ดยุคและริปคอร์ด สองทหารฝีมือเยี่ยมต้องร่วมมือกับทีมจีไอโจสุดแกร่งในการต่อสู้กับศัตรูที่มีเทคโนโลยีล้ำหน้า การปะทะกันระหว่างสองฝ่ายนำไปสู่สงครามที่เดือดระอุทั้งทางบก ทางอากาศ และใต้ทะเลลึก พวกเขาต้องปกป้องมนุษยชาติจากอาวุธทำลายล้างสูงที่อาจเปลี่ยนแปลงโลกไปตลอดกาล
