คดีสะเทือนขวัญเกิดขึ้นเมื่ออัศวินชุดเกราะผู้ลึกลับขโมยไข่มุกดำแห่งศตวรรษ ซึ่งเป็นสมบัติล้ำค่าที่เชื่อมโยงกับปริศนาของพ่อมดคนสุดท้าย โคนันต้องใช้ไหวพริบตามรอยเบาะแสในเมืองโอซาก้าที่เต็มไปด้วยกับดักอันตราย ขณะที่ไคโตะคิดและจอมโจรมายากลก็ปรากฏตัวขึ้นมาเกี่ยวข้อง การไล่ล่าครั้งนี้พาโคนันเผชิญหน้ากับเงามืดที่ซ่อนอยู่เบื้องหลังตำนานพ่อมดผู้ยิ่งใหญ่
